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高科技:帮助发现更多黑色素瘤亚型

2018-06-143627
 免疫细胞基于观察到的特征通常被分为不同的类型,例如T细胞和B细胞。但在Nature Communications上发表的一项新研究表明细胞其实更为复杂。普渡大学的研究人员创建了一种名为ACTION的算法,根据细胞的主要功能对细胞进行分组,并确定对这些功能的负责基因。发现了一种新的黑色素瘤亚型,这种皮肤癌可能有多种个性化治疗。

 

Gleic教授说:我们可以根据细胞类型来了解他们,也可以从功能角度考虑它们。并不全是纯粹的一种功能,例如,研究结果显示,可能一个功能80%,另一个功能20%。不仅单个细胞在一个区域中执行的任务存在差异,而且细胞在不同情况下的行为也不同。细胞在肿瘤周围的表现与身体其他部位不同。这些信息可以通过单个细胞的高分辨率基因表达读数来测量。

ACTION框架有助于分解这些信息并全面解读功能特性。它有三个主要组成部分:识别细胞的功能特性,根据其主导功能对它们进行分类,并重建负责调解其身份的调节系统。新发现的黑素瘤亚型与标准黑素瘤相比存活率和治疗反应不同。介导细胞功能的因素和开启、关闭功能的开关被用于这些新的亚型的确定,为未来的药物提供新的生物标志物和潜在的靶标。使用像ACTION这样的程序,我们可以为每个人获得细胞的功能性景观,这将使我们能够进行微型靶向并真正接受精准医学的治疗。

 

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https://medicalxpress.com/news/2018-06-method-cell-identification-discovery-melanoma.html

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