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大数据网络助力研究肺癌细胞信号传导途径

2018-05-243856
蒙大拿大学细胞生物学家Mark Grimes领导的一个科学家小组已经确定了肺癌细胞内的网络,这将有助于了解这种癌症并与药物治疗作斗争。

一类目前正在临床试验中名为HSP90抑制剂的新型药物是如何对抗癌症的,这是第一次大规模的研究,同时分析三种不同类型的蛋白质修饰,同时采用新的方法,涉及数学和计算方法和网络来分析这些数据。

蛋白质在细胞内以不同的方式互相修饰以传递信号,这些信号指导细胞分裂、分化或死亡,癌症就是由细胞信号传导机制出现差错所致,这项研究更加精确地定义了这些信号通路,并整合了使用不同蛋白质修饰的途径。
 
该研究着眼于45种不同的肺癌细胞类型,并将其修饰蛋白与正常肺组织进行比较。为了获得大量的数据,使用了复杂的模式识别技术(包括机器学习算法),蛋白质修饰中的模式与蛋白质相互作用网络相结合来分析肺癌的细胞信号传导途径。

由于信息的复杂性,研究人员将其类比为:细胞包括蛋白质和其他组分,如DNA,细胞内的隔室中含有不同的成分,被细胞膜隔开,想象细胞就像一座房子,其中的人是蛋白质,不同的人在不同的地方花费多少时间,这取决于他们在房子里的工作。蛋白质通过附着磷酸盐,甲基和乙酰基而彼此相互修饰,相互制约,在细胞内发挥作用。

https://medicalxpress.com/news/2018-05-big-networks-cell-pathways-lung.html

 

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